El examen MIR es una prueba de 175 preguntas de selección múltiple, el tiempo para realizarlo es de 4 horas. Cada pregunta correcta otorga 3 puntos y por cada pregunta incorrecta resta 1 punto.
Son 175 preguntas más 10 de reserva por si se detectan conflictos de formulación o errores en alguna.
No posee un temario oficial y se conforma de los temas que habitualmente se estudian en los manuales usados en las Facultades de Medicina. Incluye imágenes en algunas de las preguntas. Estas son seguidas por casos clínicos relacionados. Las imágenes se entregan en un folleto aparte al del examen y es uno de los factores que aumenta la dificultad del examen.
La nota obtenida en el examen (90 % de la nota final), junto con la evaluación del expediente académico (10% de la nota final), permite clasificar en un ranking a todos los opositores por puntuación de mayor a menor, en una lista, del primero al último, según su puntuación de examen + baremo, para realizar una selección ordenada según ranking.